严格地说，实验动物选择的正确与否，不仅影响到经费支出、工作进展，还会影响到实验结果的正确性与可靠性，以及整个实验能否顺利进行。实验研究成败的关键之一在于根据实验要求及目的不同，选择相应的动物。在选择实验动物时应注意以下原则。

　　1. 选用与人的机能、代谢、结构及疾病特点相似的实验动物医学科学研究的目的在于要解决人类的疾病，所以要选择那些机能、代谢、结构和人类相似的实验动物。一般来说，实验动物越高等，进化程度愈高，反应就愈接近人类。例如，狒狒、猩猩、猴等灵长类动物是近似人类的理想动物但是灵长类动物较难获得，价格昂贵，对饲养条件的要求特殊，所以在实际应用中常退而求其次。当然应用多的实验动物还是小鼠和大鼠，由于它们价格便宜、易于管理和控制。所以动物实验不仅仅是从整体，往往也从局部尽量选择与研究对象的机能、代谢、结构和疾病性质类似的动物。

　　2. 选用遗传背景明确，具有已知菌丛和模型性状显著且稳定的动物要使动物实验的结果可靠、有规律，得出正确的结论，就应选用经遗传学、微生物学、营养学、环境卫生学的控制而培育的标准化实验动物。故一般不选用杂种动物或普通动物，但是一般要求不高的教学实验等，则可以采用，以降低费用。

　　3. 选用解剖、生理特点符合实验目的要求的动物很多实验动物具有某些解剖生理特点，为实验所要观察的器官或组织等提供了很多便利条件，是实验成功的关键。所以要选择解剖生理特点符合实验目的要求的实验动物做实验。

　　4. 选择对实验处理敏感的品种品系实验动物实验研究常选用那些对实验因素敏感的动物作为实验对象。因不同种系实验动物往往会出现一些特殊反应，故应根据实验目的不同选择品系。

　　5. 选用人畜共患疾病的实验动物和传统应用的实验动物有些病因不仅对人而且对动物也造成相似的疾病，故应选择人畜共患疾病的实验动物。

　　6. 考虑伦理道德与“3R”原则现代动物实验考虑伦理道德与“3R”原则。其中，reduction（减少）是指在动物实验中，在不影响实验数据的情况下尽量减少动物的使用量；replacement（替代）是指使用其他的实验材料或方法替代动物，开展实验；refinement（优化）是指通过改进和完善实验程序，尽量减少对动物的伤害。充分考虑动物实验过程中的动物福利和伦理问题，能够保障实验结果的稳定和可靠。

　　7. 实验动物的个体选择除应注意以上五点原则以外，还应考虑到个体动物的年龄、性别、生理状态和健康状况等。

　　（1）年龄（Age）和体重（weight）：年幼动物一般较成年动物敏感。应根据实验目的选用适龄动物。急性实验选用成年动物。慢性实验好选用年轻一些的动物。在合格的饲养管理条件下，小型实验动物的年龄是可以按体重来估计的。

　　（2）性别（Sex）：实验证明，不同性别对同一致病刺激的反应也不同。在实验研究中，如对性别无特殊需要时，选用雌雄各半。如已证明无性别影响时，亦可雌雄不拘。雌雄性间有不同征象，通常根据征象区分性别。

　　（3）生理状态（Physiology condition）：在选择个体时，应考虑动物的特殊生理状态，如妊娠、授乳期等，因此时机体的反应性变化很大。

　　（4）健康状况（Physical condition）：健康状况不好的动物不能用来实验，对实验结果会有很大的影响。通过以下的外部表征可以判断健康动物。

　　1）总体情况（General condition）：发育完好，食欲良好，活蹦乱跳，反应敏捷。

　　2）头部（Head）：呼吸均匀，眼鼻部均无分泌物流出，眼睛有神，结膜不充血，瞳孔清晰，不打喷嚏。

　　3）皮毛（Fur）：皮毛柔软有光泽，无脱毛蓬乱现象。皮肤无感染症状。

　　4）腹部（Abdomen）：无膨大，肛门区无稀便及分泌物。

　　5）外生殖器（Ex-genitals）：无分泌物、损伤及脓痂。

　　6）爪趾（Claw）：完好，无溃疡、结痂。