根据信号基团的不同，qPCR可以分为染料法和探针法。而探针法又包含了多种类型的探针，不同的探针通过使用不同的荧光基团能发出不同波长的荧光。今天整理的这9种常见的qPCR探针类型，一起来重点了解一下~

一、TaqMan探针（TaqMan Probe）

【工作原理】一种双标记的水解探针，探针完整时，淬灭基团会抑制荧光信号。在目标扩增过程中，Tag酶会裂解结合目标序列的探针，从而使得荧光基团与淬灭基团分离，释放荧光信号。

【优势特点】特异性强；准确度和灵敏度高；可用于多重实时荧光PCR。

【具体应用】可用于乙肝病毒检测、药物研究及基础医学研究等。

二、MGB探针（Minor Groove Binder Probe）

【工作原理】一种特殊的荧光标记寡核苷酸探针，通过在传统的TaqMan探针基础上添加一个小沟结合物来增强其特异性和性能。

【优势特点】特异性更高；荧光背景更低；水解性能更高，MGB探针的设计使其在PCR扩增期间更容易被Tag酶水解，保证了荧光信号的充分释放。

【具体应用】主要用于病原体检测、传染病控制、动植物检疫以及SNP分型。

三、LNA探针（Locked Nucleic Acid Probe）

【工作原理】一种基于核酸杂交技术的检测方法，通过设计与其目标核酸序列互补的序列，利用分子间的杂交反应来检测目标序列。

【优势特点】强大的杂交亲和力和热稳定性；较高的序列结合特异性；核酸酶抗性。

【具体应用】常用于SNP检测、等位基因特异性PCR、病原体检测以及基因表达分析等研究领域。

四、PNA探针（Peptide Nucleic Acid Probe）

【工作原理】一种非常稳定的含氮杂环聚合结构，具有独特的碱性和特异性，通过设计PNA探针与目标DNA或RNA序列的特异性结合，可以实现核酸检测、基因表达调控、基因功能研究等目的。

【优势特点】具有高亲和力、高灵敏度、高特异性和高稳定性的特点。

【具体应用】主要用于肿瘤和突变位点检测、微生物检测、gene检测等。

五、RNA探针（RNA Probe）

【工作原理】一种单链RNA分子，其核苷酸序列与特定靶RNA序列具有互补性。当RNA探针与靶RNA杂交时，它们会根据碱基配对规则（A-U、C-G）结合在一起。

【优势特点】高灵敏度，能够检测到低拷贝数的RNA或DNA序列；高特异性，可以区分不同的基因序列，甚至同一种基因的不同亚型；杂交效率高。

【具体应用】主要用于分子诊断、基因表达分析、RNA病毒检测、荧光原位杂交等。

六、双杂交探针（Dual Hybridization Probe）

【工作原理】一种基于一对寡核苷酸探针的设计，将两种蛋自质分别与两种不同的发光蛋白衔接片段连接，当这两种蛋白质在细胞内相互结合时，发光蛋白衔接片段就会连接在一起，从而使发光蛋白激活井发出荧光信号。

【优势特点】强高特异性；低背景噪声；多色检测能力；可快速获取结果。

【具体应用】主要用于基因突变检测、病原体检测、基因表达分析等领域。

七、分子信标探针（Molecular Beacons Probe）

【工作原理】一种基于荧光共振能量转移（FRET）原理的核酸探针，利用荧光分子标记的DNA或RNA分子，通过特定的靶标序列与探针序列的碱基互补配对，实现对靶标基因或蛋白质的检测。

【优势特点】高特异性；高灵敏度；背景信号低；适用范围广。

【具体应用】主要用于实时定量PCR、病原体检测、DNA与蛋白质相互作用研究等领域。

八、蝎形探针（Scorpions Probes）

【工作原理】原理与分子信标探针十分类似，不同点在于，蝎形探针3’端带了PCR引物，反应中得到的产物与蝎形探针为一个分子，探针的杂交在分子内部，而不需要两个分子参与，从而使杂交反应更加迅速、高效。

【优势特点】高效快速；高特异性；更经济实惠。

【具体应用】主要用于基因突变检测、病毒RNA/DNA检测、细胞诊断、SNP分析等。

九、双淬灭探针（Double-Quenched Probe）

【工作原理】当探针完整时，荧光基团发出的光能被淬灭基团吸收，难以产生明显的荧光信号。但在PCR扩增过程中，随着聚合酶沿模板链延伸并切割探针，荧光基团从探针上分离出来，不再受到淬灭基团的影响，从而能够发射出明显的荧光。

【优势特点】降低荧光背景信号；高灵敏度；适用长链探针。

【具体应用】主要用于核酸检测、肠癌患者肠道菌群检测、长链探针检测等。