转录是将DNA链中的信息复制到新的信使RNA (mRNA) 分子中的过程。
在原核生物中,转录发生在三个阶段,即起始、延伸和终止。
涉及的酶
RNA由含有多个多肽亚基的单一RNA聚合酶合成。
在大肠杆菌中,RNA聚合酶具有亚基:两个α、一个β、一个β'和一个ω和σ亚基(α2ββ'ωσ)。这种完整的酶被称为全酶。
σ 亚基可以与其他亚基解离,留下一种称为核心酶的形式。
启动阶段
在起始过程中,RNA 聚合酶识别 DNA 上的特定位点,该位点位于将被转录的基因的上游,称为启动子位点,然后在局部解开 DNA。
发起人和发起人
全酶与大小约为 40-60 bp 的启动子区域结合,然后在下游短距离处(即启动子的 3 处)启动转录。
在启动子内有两个对启动子功能特别重要的 6 个碱基对序列。
它们在物种之间高度保守。
使用将转录序列的第一个核苷酸称为 +1 的惯例,这两个启动子元件位于位置 –10 和 –35,即分别约 10 和 35 bp,转录开始的上游。
–10 序列有共识因为这个元素是由 Pribnow 发现的,所以它也被称为 Pribnow 盒子。它是与RNA聚合酶的σ因子相互作用的重要识别位点。
–35 序列具有共有的TTGACA,在转录起始期间的 DNA 解旋中很重要。
RNA聚合酶不需要引物即可开始转录;与启动子位点结合后,RNA聚合酶直接开始转录。
伸长阶段
转录起始后,σ 因子从转录复合物中释放出来,留下核心酶(α2ββω),继续延伸 RNA 转录物。
核心酶包含聚合的催化位点,可能在 β 亚基内。
RNA 转录本中的第一个核苷酸通常是 pppG 或 pppA。
然后,RNA 聚合酶以 5'→3' 方向合成 RNA,使用四种核糖核苷 5-三磷酸(ATP、CTP、GTP、UTP)作为前体。
生长的 RNA 链末端的 3-OH 攻击进入的核糖核苷 5-三磷酸的 α 磷酸基团,形成 3'5' 磷酸二酯键。
RNA聚合酶、DNA模板和新的RNA转录物组成的复合物称为三元复合物(即三个组分),未缠绕的DNA进行转录的区域称为转录泡。
RNA 转录物与其模板链形成一个短暂的 RNA-DNA 杂合螺旋,但随后随着转录的进行从 DNA 上剥离。
DNA 在转录气泡之前展开,转录复合物通过后,DNA 会倒带。
因此,在延伸过程中,RNA 聚合酶使用 DNA 的反义 (-) 链作为模板并合成互补的 RNA 分子。
产生的 RNA 与非模板链具有相同的序列,称为有义 (+) 链(或编码链),只是 RNA 包含 U 而不是 T。
在细菌染色体上的不同位置,有时一条链用作模板,有时另一条链用作模板,这取决于哪条链是相关基因的编码链。
通过启动子位点的存在,为 RNA 聚合酶鉴定了用作模板的正确链。
终止阶段
转录继续进行,直到达到终止序列。
最常见的终止信号是一个富含 GC 的区域,它是一个回文,然后是一个富含 AT 的序列。
由 DNA 回文制成的 RNA 是自我互补的,因此在内部形成碱基对,形成富含 GC 碱基对的发夹结构,然后是四个或更多的 U 残基。
然而,并非所有终止位点都具有这种发夹结构。那些缺乏这种结构的人需要一种额外的蛋白质,称为rho,以帮助识别终止位点并停止转录。
因此,RNA 聚合酶遇到终止信号并停止转录,释放 RNA 转录物并从 DNA 上解离。
RNA加工
在原核生物中,从蛋白质编码基因(信使 RNA、mRNA)转录的 RNA 在翻译前几乎不需要或不需要修饰。
许多 mRNA 分子甚至在 RNA 合成完成之前就开始翻译。
然而,由于核糖体 RNA (rRNA) 和转移 RNA (tRNA) 是作为前体分子合成的,因此它们需要进行转录后处理。
意义
DNA转录是调节基因表达的方法。
它发生在蛋白质翻译的准备过程中并且是蛋白质翻译所必需的。