现如今,大家在购买细胞株的时候,会面临诸多突出的问题:
①细胞活性不足,收到细胞后存活率不高,导致实验无法正常进行;
②细胞本身的质量无法保证,除知名正规单位的细胞外,无法确认细胞源本身质量;
③市场上以次充好、良莠不齐、鱼龙混珠的假细胞比比皆是、无法分辨。
如果你一不注意,使用了没有经过相应的细胞鉴定的细胞、或者是被污染的细胞,极有可能的结果就是——论文的结论被推翻、论文被召回,这中间大量的时间、物力和人力均被浪费,一切都要从头再来。
这样的案例并不少见,因此,在2017 年,有调查机构抽查了中国 28 个研究机构中保存的 278 个细胞系,并对细胞进行鉴定,调查结果显示,有128 个细胞系是错误鉴定的,错误率高达46%。
大量的前车之鉴表明,你的实验室的细胞急需一张合法的“本本”来证明自己的身份!
细胞STR鉴定——给你的细胞一个“明明白白的”身份
正如人类个体有指纹识别一样,每种细胞系也有它的独一无二的“指纹”:STR。
STR,全称Short tandem repeat,中文名“短串联重复序列”,是一类广泛存在于真核生物基因组中的 DNA 串联重复序列。由于不同个体来源的细胞在不同 STR 位点具有特异性的重复次数,因而使得不同细胞具有其特征性的图谱,根据图谱的数据可以判定细胞是否为单一细胞。
近年来,大量研究表明STR基因分型方法是进行细胞交叉污染和性质鉴定的最有效和准确的方法之一,目前,此方法已被ICLAC、ATCC等权威机构作为金标准应用于细胞鉴定。
俗话说:方向错了,越用力就在错误的道路上越走越远。在努力之初,就“正本清源”,可以避免后面的风险哦。
细胞STR鉴定的特点
STR 图谱鉴别通过标准化的操作,采用自动化的 DNA 分析仪对 PCR 产物进行精确的分析,并以简单的数字描述STR序列重复次数,不仅增加了结果的客观性,而且所需细胞数量少(最低只需1×10^3个细胞),而细胞检定中常规采用的同工酶法通常需要5×10^6个细胞,结果还没那么稳定,特异性也不强。
总的来说,STR法分型快速、经济、易于自动化,可重复性好,且数据格式适合建立一个标准参考数据库的特点,所以应用价值极大。
如果您正处于以下几种情况,请及时对自己手里的细胞进行STR鉴定:
1、发表文章或申请课题经费前;
2、使用细胞进行临床治疗(试验)前;
3、准备冻存保种或已冻存多年的细胞;
4、一个涉及到细胞试验项目开始/结束时;
5、新得到的细胞或实验室传5代以上的细胞;
6、细胞系表现不稳定或结果与预期差别较大;
7、异体细胞移植后嵌合情况检查。