资讯动态

蛋白质泛素化研究很难?首先你需要知道这些!

2024-05-28 10:04:28
|
访问量:111972

蛋白质作为生命功能的主要执行物质,其功能研究一直备受青睐,而蛋白质翻译后修饰作为调节蛋白质生物学功能的关键步骤之一,也成为了众多科研人的聚焦点。

 近年,泛素化相关文章发表量逐年上升。今天我们就给大家介绍一下泛素化的基本概念,并结合案例分享研究思路,最后给大家简单介绍一下相关的实验技能。

一、什么是泛素化

泛素化是蛋白质翻译后修饰的一种形式,其过程包括蛋白酶体的蛋白质降解、细胞周期进程、转录调控、DNA修复和信号转导。泛素通过其C末端与赖氨酸的ε-氨基共价连接,或(较少)与蛋白质的N末端形成肽键。

泛素化的发生需要以下三种酶的连续作用:

1.泛素激活酶(E1)催化泛素的ATP依赖性活化,并在泛素C末端和半胱氨酸之间形成硫酯键;

2.泛素被转移到泛素缀合酶(E2s)催化的半胱氨酸中;

3.最后,泛素通过泛素连接酶(E3)转移到底物上。

其中,E3是泛素化途径中最异质的一类酶,它们介导的底物具有特异性。目前,根据特征结构域的存在和泛素转移到底物蛋白的机制,可以将E3连接酶分为三种类型:

类型1:RING E3s

图片1.png

这是最丰富的一类泛素连接酶,它们拥有一个锌结合结构域,或是一个U-box结构域,该结构域具有相同的环褶皱,但不含锌。环和U-box结构域负责结合E2和刺激泛素转移。

类型2:HECT E3s

图片2.png

HECT与E6AP羧基末端同源,其结构域家族的E3连接酶通过2步反应催化,转移到底物蛋白:首先将泛素转移至E3上的催化半胱氨酸,然后从E3转移到底物。

类型3:RBR E3s

 

图片3.png

与HECT E3s类似,RBR E3连接酶通过2步反应催化转移到底物蛋白:首先将泛素转移至E3上的催化半胱氨酸,然后从E3转移到底物。

RBR E3连接酶包含特定于每个成员的额外结构域,结构域参与分子内相互作用,使蛋白质处于自身抑制状态。而这种状态可以通过各种机制释放,如磷酸化或蛋白质-蛋白质相互作用。

在对泛素化有了一定的了解后,接下来就和我们一起结合高分文章,学习如何将泛素化结合到我们的研究当中。

二、案例分析

图片4.png

本文作者主要研究泛素化在自噬中与DDR信号串扰之间的相互作用。

IR治疗可以激活许多肿瘤自噬,而组蛋白H2A和H2AFX/H2AX响应的DNA DSBs泛素化是一种关键的翻译后修饰,具有介导下游信号传导,DNA修复因子募集的作用。因此,作者认为泛素化和去泛素化信号可以有效动态调节DDR。

1、前列腺癌细胞中自噬抑制能诱导DNA损伤

图片5.png

2、USP14破坏自噬缺陷细胞中的DDR信号传导

图片6.png

3、SQSTM1与USP14结合且调节其水平

图片7.png

 

4、USP14是自噬底物

图片8.png

5、USP14介导RNF168泛素化

图片9.png

6、USP14调节RNF189的泛素化来影响其蛋白水平

图片10.png

三、相关实验技能

蛋白泛素化检测(IP-WB法):IP-WB法通过免疫共沉淀将目标蛋白与其结合的蛋白分离,将分离的蛋白再进行SDS电泳和Western Blot检测。

具体步骤:

(1)将目标蛋白真核表达载体和带HA tag的泛素载体共转染细胞(可以是所研究的细胞,也可以用工具细胞293T)

(2)24小时后加入20µM蛋白酶体抑制剂(MG-132),孵育4小时后收取细胞

(3)加入预冷的细胞裂解液(使用前加入PMSF和磷酸酶抑制剂),于冰上裂解30min

(4)4℃,12000转离心20min,提取上清蛋白至新的EP管中,加入1µg目标蛋白抗体,4℃缓慢摇至过夜

(5)加入20µl的Protein AG beads,继续4℃缓慢摇转4小时

(6)4℃,2500转离心5min,小心吸除上清,沉淀中加入1mlPBS洗涤,洗涤后,4℃,2500转离心5min,洗涤步骤重复3-5遍

(7)沉淀中20µl 1xSDS PAGE电泳上样缓冲液,Vortex轻微震荡重悬沉淀

(8)4℃瞬时高速离心将样品离心至管底,与沸水中煮沸10min

(9)上清进SDS PAGE电泳,用Western Blot检测泛素化情况(用HA标签抗体)

以上就是本篇文章的全部内容~

文章推荐
常见的蛋白质分离纯化方法(破碎组织细胞的方法)
2022-08-21
分离提纯某一种蛋白质时,首先要把蛋白质从组织或细胞中释放出来并保···
细胞得率计算公式及方法详解,细胞得率高低原因分析
2023-07-26
作为生物学中的重要指标之一,细胞得率是指细胞培养中细胞的增殖率,···
细胞培养原虫污染的危害及处理方法,细胞培养原虫污染预防措施
2023-09-07
细胞培养是一种重要的实验技术,被广泛应用于生物医学研究、药物开发···
流式检测细胞凋亡原理及应用解析,细胞凋亡检测方法与步骤
2023-12-07
流式检测细胞凋亡原理是一种用于研究细胞凋亡的先进技术。细胞凋亡是···
“线粒体稳态”新思路!成功拿下中科院1区10.7分!揭秘Slc25a3铜转运对线粒体的影响机制→
2025-05-12
线粒体是真核细胞的能量中心,广泛参与许多细胞生物学过程,需要多层···
6种常见代谢综合征疾病模型汇总
2025-05-09
1.非酒精性脂肪肝小鼠模型(NASH)①高脂饮食诱导肥胖(DIO)模型:通···
超详细版|PCR引物设计8大原则
2025-04-30
一、PCR引物设计目的PCR引物设计的目的是寻找到一对合适的核苷酸片段···
中科院1区14.7分!“细胞炎症”国自然中标思路!南京医科大学陈琪团队发现调控新靶点→
2025-04-28
炎症是生物学的重要组成部分。它可以为机体提供保护,并维持组织和器···
  • 业务咨询

    业务咨询专线:133 7682 0615

    Email:lxyjy@wie-biotech.com

服务报价
打开微信—点击右上角扫一扫
×
在线留言
留言咨询
「扫码查看详细服务价格」

感谢您的关注,如有需要请留言,我们会尽快和您联系!