资讯动态

WB磷酸化/泛素化/乙酰化/乳酸化怎么看?

2025-01-06 18:06:51
|
访问量:1392

之前给大家分享过Co-IP的解读,今天就给大家带来WB图片的解读,下面就一起学习吧~


一、WB-磷酸化

image.png


1. 图片解读

(1) 处理条件:每组样本都经过了不同时间的LPS(脂多糖)处理,时间点为0h、2h和4h

(2) 样本分组:两组样本,分别是WT(野生型)和KO(敲除型)

(3) 分子量标记:kDa数值表示蛋白质的分子量,用于估计检测到的蛋白条带的大小

(4) 条带分析:KO组的Jnk蛋白的磷酸化水平(P-Jnk)明显高于WT组。同理可观察其他蛋白的磷酸化条带

(5) P-lkkα/β和Ikkα/β:检测Ikkα/β蛋白的磷酸化状态(P-)和总蛋白量。lkkα/β、lkbα、Jnk、p38蛋白均属于NF-κB或JNK通路的相关蛋白

(6) Cypj:实验相关蛋白,在本实验中KO组敲除的是Cypj,因此在KO组中没有Cypj条带

(7) Tubuin:作为内参蛋白,用于校正蛋白加载量的差异,确保各泳道的蛋白加载量一致


2. 结果解读

(1) 用LPS处理野生型和Cypj敲除组0h、2h、4h后,用Western Blots检测Ikka/BIkba、Jnk和p38的磷酸化水平。根据实验结果发现,Cypj缺乏增加了NF-KB和JNK通路中这些激酶的磷酸化


3. 常见问题

(1) 为什么P-lkka/B、lkka/B、P-Jnk、Jnk泳道中出现两个条带?

因为蛋白存在不同亚型,它们在分子量上有所差异,因此在WB中会显示出多个条带


二、WB-泛素化

image.png


1.图片解读

(1)MG132:一种蛋白酶抑制剂,能够抑制26S蛋白酶体(泛素-蛋白酶体系统,UPS)的活性。UPS负责降解泛素标记的蛋白质,维持蛋白质质量并调节蛋白水平。MG132阻断这一过程,使得泛素标记的蛋白质在细胞内积累

(2)Vector:对照组,表示一个不含目的基因的载体被导入细胞中

(3)“+”“-”标记:“+”表示添加该条件,“-”表示未添加该条件

(4)His-PSAT1:目的蛋白,给PSAT1蛋白加了His标签

(5)kDa:分子量的单位,被用作一个标准,帮助确定观察到的条带是否是正确的分子量

(6)IP:HiS:用His抗体做IP,分别下拉His和Ub分子;可以明显观察到,添加了MG132的His-PSAT1样本泳道更暗(Ub表达量更多)

(7)Input:指加载到WB膜上的原始样本的一部分,通常用于显示加载量是否一致,从而作为判断不同条带之间信号强弱的依据

(8)Tubulin:一种常用于细胞骨架标记的蛋白,在WB中作为内参蛋白可以校正不同泳道中的蛋白上样量,确保每个泳道中的蛋白量相同


2.结果解读

(1)该实验研究了MG132处理下PSAT1的泛素化。结果表明,添加MG132后,PSAT1的泛素化显著增加。


3.常见问题

(1)为什么泛素化条带会拖尾?

①泛素分子的分子量在8.5kDa左右,而泛素化是由许多泛素分子串联起来的,因此泛素化没有固定大小,跑出来就是一串长条带;

②其他原因还包括上样量过大、样本降解或样品中有杂质、一抗浓度过高或孵育时间过长等。


三、WB-乙酰化

image.png


1.图片解读

(1)Ac K298和Ac K302条带:这两个是赖氨酸乙酰化(Ac)的位点,分别在赖氨酸298和302位点(二者位于C/EBPα上)。可以看到【HL-60+HDACi】组的条带强度明显增加,而【32D+G-CSF】组的条带信号显著减弱,这可能表明HDACi处理增加了K298、K302位点的乙酰化水平,而G-CSF的增加则降低了这些位点的乙酰化

(2)C/EBPa:一种转录因子参与调节多种基因的表达

(3)GCN5:一种组蛋白乙酰转移酶,参与组蛋白的乙酰化。【32D+G-CSF】组的条带信号显著减弱,表明G-CSF的添加降低了GCN5的表达

(4)样本分组:分为4组样本,HL-60和32D是两种细胞系,HDACi是一种组蛋白去乙酰化酶抑制剂;IL-3为白细胞介素,32D细胞的生存和增殖依赖于IL-3;G-CSF是粒细胞集落刺激因子。在去除IL-3和加入G-CSF后,32D细胞很容易分化为成熟的粒细胞

(5)分子量标记:kDa数值表示蛋90 kD白质的分子量,用于估计检测到的蛋白条带的大小

(6)β-actin:作为内参蛋白,用于校正蛋白加载量的差异

 

2.结果解读

(1)Western blot结果显示,在G-CSF启动分化前(没加入G-CSF前),32D细胞中C/EBPa的K298和K302位点乙酰化富集。而在G-CSF诱导下,K298和K302的乙酰化水平降低,这与GCN5蛋白表达的减少相一致。

 

3.常见问题

(1)蛋白乙酰化,除了跑WB,还有哪些检测方法?

(2)除了WB之外,检测蛋白乙酰化的方法还包括免疫荧光、免疫共沉淀、质谱分析、蛋白质芯片等。WB在成本和易用性上具有优势,能提供乙酰化蛋白定性和半定量信息,而质谱分析则可以提供精准的乙酰化位点信息,但技术要求高、成本高。


四、WB-乳酸化

image.png


1.图片解读

(1)Pan-Kla 条带:Pan-kla是指组蛋白H4第12位赖氨酸乳酸化修饰(-la),它也被称为泛乳酸化修饰泛抗体,因为它能够检测细胞内所有蛋白质的乳酸化修饰。在Lactyl-CoA存在的情况下,信号较弱/无信号;而在LactyI-CoA与TIP60共同存在时,信号增强,这可能表明TIP60对乳酸化赖氨酸有影响

(2)实验条件:LactyI-CoA(乳酸酰辅酶A)、NBS1、TIP60(组蛋白乙酰转移酶)的存在或缺失(用“+”表示存在“-”表示缺失)

(3)分子量标记:表示蛋白质的分子量。所有检测的蛋白质分子量都在100kDa左右

(4)NBS1-K388la条带:该条带显示了NBS1蛋白在第388位赖氨酸的乳酸化修饰。在LactyI-CoA存在时,信号较弱/无信号,而在Lactyl-CoA与TIP60共同存在时,信号增强,这可能表明TIP60对NBS1-K388的乳酸化也有影响

(5)NBS1条带:该条带显示了NBS1蛋白的总量。所有条件下NBS1的表达量相对稳定,说明实验条件对NBS1蛋白的总量影响不大。NBS1是一种在细胞DNA损伤修复中起关键作用的蛋白质

 

2.结果解读

(1)体外赖氨酸乳酸化实验证实TIP60介导NBS1-K388的乳酸化


文章推荐
大鼠星型胶质细胞培养胰酶消化法
2022-11-16
材料与仪器SD大鼠苯巴(匕匕)妥 解剖液 胰蛋白酶 Dnase DM培养液离心···
流式检测细胞凋亡步骤详解,流式细胞凋亡检测的实验操作流程
2023-10-31
本文将介绍流式检测细胞凋亡的步骤。细胞凋亡是一种重要的细胞死亡方···
细菌与真菌的区别(真菌与细菌的主要区别是什么)
2022-03-08
细菌和真菌的名称中均有一个“菌”字,同属微生物,但两者在生物类型···
细胞凋亡与细胞坏死的区别(细胞死亡的两种不同方式)
2023-08-26
细胞死亡是生命过程中不可避免的一部分。在细胞死亡的过程中,细胞凋···
WB磷酸化/泛素化/乙酰化/乳酸化怎么看?
2025-01-06
之前给大家分享过Co-IP的解读,今天就给大家带来WB图片的解读,下面就···
IF15+/Science子刊!上海交大殷善开/时海波团队揭示新生儿黄疸合并酸中毒神经毒性的“幕后真凶”!
2025-01-03
黄疸是指由于高胆红素血症所引起的皮肤和黏膜的黄色改变。那么关于黄···
这7种富集分析方法超实用,快快码住!
2024-12-30
富集分析方法主要用于理解基因集合或其他生物学实体在给定实验条件下···
中科院1区TOP/IF11.7!南方医科大学白晓春团队揭示糖尿病足溃疡修复新机制,成功拿下Cell子刊!
2024-12-27
糖尿病是一种以持续高血糖为特征的代谢性疾病,其原因可能是胰腺β细···
  • 业务咨询

    业务咨询专线:133 7682 0615

    Email:lxyjy@wie-biotech.com

在线留言(即刻联系为您提供专业的解决方案) ×
留言咨询

感谢您的关注,如有需要请留言,我们会尽快和您联系!