PCR清洁试剂盒纯化法
方法原理
硅胶膜可在高盐条件下结合DNA,又可在低盐条件下与DNA分离。DNA溶液中的引物、单核苷酸、酶、矿物油、盐离子等杂质因为没有与DNA相似的特性,所以被分离开来。
实验材料:
PCR产物,试剂、试剂盒,PCR清洁试剂盒
仪器耗材:
96孔DNA制备板、96孔深孔板、96孔V型底板
[ 试剂盒组成、贮存、稳定性]
耗材:96孔DNA制备板,96孔1.6ml深孔板,96孔V型底板。
BufferPCR-A:DNA结合溶液。室温密闭贮存。若出现沉淀,应于65℃温浴溶解并冷却至室温后再使用。
BufferW2concentrate:去盐液。使用前,根据瓶上指定的体积加入乙醇,混合均匀,室温密闭贮存。可用100%乙醇或95%无水乙醇
Eluent:2.5mMTris-HCl,pH8.5。室温密闭贮存。
实验操作
A. 负压法
正确连接负压装置,将96孔DNA制备板置于负压装置上;
在PCR、酶切、酶标或测序反应液中,加3个体积的BufferPCR-A(若BufferPCR-A不足100ul,加至100ul);
混合均匀后转移到96孔DNA制备板中,开启并调节负压至-25-30英寸汞柱,缓慢吸掉板中溶液。
加0.3mlBufferW2,吸尽管中溶液。以同样的方法再用0.3mlBufferW2洗涤两次。
保持负压将96孔DNA制备板抽吸10min。
导流管朝下将96孔DNA制备板于长纤维性纸巾上用力拍击6次。
将96孔DNA制备板置于96孔V型底板上,在膜正中央加25-30ul水或Eluent,室温静置1min。3000xg离心5min,洗脱DNA。
*确认在BufferW2concentrate中已按试剂瓶上的指定体积加入无水乙醇。
B. 离心法
在PCR、酶切、酶标或测序反应液中,加3个体积的BufferPCR-A(若BufferPCR-A不足100ul,加至100ul);
混匀后,转移到96孔DNA制备板中,将96孔DNA制备板置于96孔1.6ml深孔板中,1000xg离心1min,弃滤液。
在96孔DNA制备板中,加0.3mlBufferW2,1000xg离心1min,弃滤液,以同样的方法再用0.3mlBufferW2洗涤一次。
将96孔DNA制备板置于96孔1.6ml深孔板中,3000xg离心10min。
将96孔DNA制备板置于洁净的96孔V型底板中,在膜正中央加25-30ul水或Eluent,室温静置1min。3000xg离心5min,洗脱DNA。
*确认在BufferW2concentrate中已按试剂瓶上的指定体积加入无水乙醇。
DNA凝胶回收试剂盒纯化法
方法原理
琼脂糖凝胶在温和的缓冲液(DE-A溶液)中溶解,其中的保护剂能防止线状DNA在高温下降解,然后在DE-B溶液的作用下使DNA选择性结合到膜上。纯化的DNA纯度高,并保持片断完整性和高生物活性,可直接用于连接、体外转录、PCR扩增、测序、微注射等分子生物学实验。
仪器耗材:
DNA制备管、2ml离心管、1.5ml离心管
[ 试剂盒组成、贮存、稳定性]
BufferDE-A:凝胶熔化剂,含DNA保护剂,防止DNA在高温下降解。室温密闭贮存。
BufferDE-B:结合液(促使大于70bp的DNA片段选择性结合到DNA制备膜上)。室温密闭贮存。若出现沉淀,于70℃温育溶解并冷却至室温后使用。
BufferW1:洗涤液,室温密闭贮存。
BufferW2concentrate:去盐液,使用前,根据瓶上数量加入乙醇,混合均匀,室温密闭贮存。
100%无水乙醇或95%乙醇。
Eluent:2.5mMTris-HCl,pH8.5,室温密闭贮存。
实验操作
在紫外灯下切下含有目的DNA的琼脂糖凝胶(切成细小碎块,勿长时间暴露在紫外灯下,以防损伤DNA),用纸巾吸尽凝胶表面液体并切碎。
计算凝胶重量(提前记录1.5ml离心管重量),该重量作为一个凝胶体积(如100mg=100ul体积)。
加入3个凝胶体积的BufferDE-A,混合均匀后于75℃加热(低熔点琼脂糖凝胶于40℃加热),间断混合(每2-3min),直至凝胶块完全熔化(约6-8min)。
加0.5个BufferDE-A体积的BufferDE-B,混合均匀;当分离的DNA片段小于400bp时,加入1个凝胶体积的异丙醇。
步骤4-6可以选择负压法或离心法。
A.负压法
4A.正确连接负压装置,将DNA制备管插到负压装置的插口上。吸取步骤3中的混合液,转移到制备管中,开启并调节负压至-20-30英寸汞柱,缓慢吸走管中溶液。
5A.加0.5mlBufferW1,吸尽管中溶液。
6A.加0.7mlBufferW2,吸尽管中溶液。以同样的方法再用0.7mlBufferW2洗涤一次。
B.离心法
4B.吸取3中的混合液,转移到DNA制备管(置于2ml离心管)中,12000xg离心1min。弃滤液。
5B.将制备管置回离心管,加0.5mlBufferW1,12000xg离心30s,弃滤液。
6B.将制备管置回离心管,加0.7mlBufferW2,12000xg离心30s,弃滤液。(可选步骤)以同样的方法再用0.7mlBufferW2洗涤一次,12,000xg离心1min。
7.将制备管置于2ml离心管中,12000xg离心1min。
8.将制备管置于洁净的1.5ml离心管中,在DNA制备膜正中央加25-30ul水或Eluent,室温静置1min。12000xg离心1min,洗脱DNA。
*确认在BufferW2concentrate中已按试剂瓶上的指定体积加入无水乙醇。